Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RPL10P6-201ENST00000457497 318 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PTPREP23469 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTPREP23469 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 AP003174.3-201ENST00000537926 516 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PTPREP23469 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 INO80C-212ENST00000592173 3245 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPREP23469 TARS2P1-201ENST00000506124 2041 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPREP23469 GJA10-201ENST00000369352 1652 ntAPPRIS P2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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