Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms