Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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CCDC142Q17RM4 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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