Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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