Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms