Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms