Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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CHD4Q14839 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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