Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 BPTF-203ENST00000335221 2627 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MGC15885-201ENST00000558940 2425 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF365-211ENST00000614806 877 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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