Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1
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PTPRMP28827 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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PTPRMP28827 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 ALMS1-204ENST00000484298 12595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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PTPRMP28827 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
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PTPRMP28827 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
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PTPRMP28827 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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PTPRMP28827 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
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