Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA3Q9Y6H8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA3Q9Y6H8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms