Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN3Q9Y4C0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms