Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN4Q9Y3Q4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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HCN4Q9Y3Q4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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HCN4Q9Y3Q4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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HCN4Q9Y3Q4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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HCN4Q9Y3Q4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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HCN4Q9Y3Q4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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HCN4Q9Y3Q4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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HCN4Q9Y3Q4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN4Q9Y3Q4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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