Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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