Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHIC2Q9UKJ5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms