Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCAN3Q9UKA8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms