Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
IFT172Q9UG01 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms