Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms