Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms