Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms