Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDP1Q9NUW8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDP1Q9NUW8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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