Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms