Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
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