Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms