Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms