Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYCP2Q9BX26 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms