Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT61BQ9BVS5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRMT61BQ9BVS5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRMT61BQ9BVS5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRMT61BQ9BVS5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRMT61BQ9BVS5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRMT61BQ9BVS5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRMT61BQ9BVS5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRMT61BQ9BVS5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRMT61BQ9BVS5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRMT61BQ9BVS5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRMT61BQ9BVS5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRMT61BQ9BVS5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms