Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms