Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms