Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MESP1Q9BRJ9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms