Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms