Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms