Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms