Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF183Q96D59 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms