Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC47Q96A33 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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