Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms