Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOPBP1Q92547 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms