Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTLL11Q8NHH1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms