Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
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