Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms