Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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