Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM179Q6ZVK1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM179Q6ZVK1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms