Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FGD6Q6ZV73 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms