Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms