Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms