Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASC4Q6P4E1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASC4Q6P4E1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASC4Q6P4E1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASC4Q6P4E1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASC4Q6P4E1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms