Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40BQ6NWY9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms