Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRC8EQ6NSJ5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms