Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP350Q5VT06 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP350Q5VT06 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP350Q5VT06 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms