Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEND3Q5T5X7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms