Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms